渡邉信久
Refmac5 から protin 形式の辞書データを使わなくなったので,かなり楽になっ た.Refmac5 の MAKE_restraints で PDB file から自動的に disulphide bonds や cis-peptides を探し,束縛情報を作成する.また,protin の補欠分子デー タを作成するのは大変だったが,それも Monomer Library Sketcher を使うこと で,かなり容易に出来る.
ここでは,例によって ccp4i を使用する.ccp4i に関しては
http://castor.sci.hokudai.ac.jp/~watanabe/Manuals/ccp4i/index.html
に書いたので,そちらを参照して下さい.また,Refmac5 のマニュアルは
http://castor.sci.hokudai.ac.jp/~sapporo/ccp4_man/refmac5.html
にある.